関東方面からはJR豊橋駅から名鉄に乗り換えて東岡崎駅まで約20分。
関西方面からはJR名古屋駅から名鉄名古屋駅で豊橋方面行きに乗り換えて東岡崎駅まで約30分。
東岡崎駅からは下記のとおりです。
明大寺キャンパス
中央改札口を出て南口より徒歩約７分。
※駅構内にエレベーターがありますが、東口に出ますのでご注意ください。
山手キャンパス
駅南口から名鉄バス［竜美丘循環］竜美北１丁目（所要５分）で下車，徒歩3分。
または徒歩で約20分。
２つのキャンパスは、名鉄「東岡崎」駅の南側徒歩圏内に位置しています。キャンパス間は徒歩15分程度の距離にあり徒歩で行き来できます。また、キャンパス間で連絡バスが運行されています。
キャンパスマップは、こちら をご覧ください。
東名高速道路岡崎インターチェンジを下りて国道一号線を名古屋方面に約1.5キロ市役所南東の信号を左折。岡崎インターから約10分。
中部国際空港から名鉄に乗車し、神宮前駅で豊橋・東岡崎方面に乗り換え、東岡崎駅で下車。所要約60分。
※空港バス岡崎方面行きは運行を休止しました。（2019年8月4日）
分子科学研究所は「明大寺」「山手」の２つのキャンパス（キャンパスマップはこちら）があります。
各グループリーダーの所在キャンパスは研究者一覧よりご覧ください。
明大寺キャンパス：〒444-8585 愛知県岡崎市明大寺町字西郷中38番地
山手キャンパス：〒444-8787 愛知県岡崎市明大寺町字東山5-1
電話番号 0564-55-7418（受付）
宿泊先案内---共同利用研究者宿泊施設、分子科学研究所周辺の主なホテル
鉄道 ---JR東海、JR東日本、JR西日本、名鉄
バス ---名鉄バス
空港 --- 中部国際空港
